航道：以高等级航道为主体
据了解，江西省将全面改善赣江、信江、赣江东河等航道的通航条件，构筑以水运主通道长江干线江西段、赣江、信江为骨架的“两横一纵”国家高等级内河骨干航道体系。重点建设赣江樟树至南昌三级航道、赣江石虎塘航电枢纽、赣江东河南昌至瓢山四级航道整治工程、赣江南昌至湖口二级航道、信江双港枢纽、信江双港至褚溪河三级航道。到2010年，新增二级航道156公里、三级航道287公里、四级航道87公里，江西全省三级以上航道里程达599公里。
港口：发挥主要港口枢纽作用
以集装箱码头和专业化码头为重点，发展专业化泊位。加快改造建设九江港、南昌港等主要港口，形成以主要港口为龙头，以赣州港等10个区域性重要港口为依托，其他一般港口为基础的层次分明、功能完善、布局合理的港口体系，促进沿江产业带的形成，服务区域经济发展。“十一五”期间，江西全省每年新增港口货物吞吐能力2641万吨，集装箱吞吐能力43万标箱，1000吨至5000吨级泊位24个，500吨至1000吨级泊位12个。
水路运输：调整船舶运力结构
为进一步提高水路运输比例，江西省将充分发挥水运区位优势，创新水陆中转、水水中转、水陆水中转运输模式，大力发展江海直达运输。此外，着力促进船舶运力结构调整，推进船舶大型化、标准化、专业化，重点发展集装箱、液化品、散货等江海直达运输船舶，提升全社会船舶净载能力。到2010年，全省全社会船舶净载重达到150万吨，船舶标准化率超过50%，货运船舶平均吨位达到400吨。
水上安全：推进五大系统建设
为提高水运安全保障能力，江西省将加快建设水域监控系统、水上搜救系统、船舶污染防治系统、海事基础设施与技术装备系统以及重点港口、客运码头、水上旅游、风景区码头远程视频监控等五大系统，重点推进江西省水上搜救中心和鄱阳湖分中心建设，使主要航区的安全保障能力显著提升。（记者胡萍）