据介绍，2005年库尔勒市启动新农合以来，农牧民参合积极性不断提高，目前参合率达到99.8%，基本缓解了广大农牧民群众看病难和看病贵问题。但由于筹资水平低，新农合基金的压力逐年增加，在一定程度上影响了农牧民患者正常就医，2013库尔勒市参合农牧民104681人，人均筹资379元（中央188元，自治区51元，巴州10元，库尔勒市70元，个人缴费60元/人），共筹集合作医疗基金3967.4万元。但截至8月底，门诊和住院补偿农牧民患者75922人次，受益率达72.53%，补偿新农合基金3016.6万元。补偿资金占当年总筹集基金的76.03%，预计2013年全年新农合基金支出4524万元。因此，新农合基金将至少有600万元的缺口，目前筹集到的基金已不能解决农牧民患者就医补偿。
为了确保所有参合农牧民都能够公平享受到新农合的惠民政策，库尔勒市2014年新农合市财政补助标准由目前的70元提高到100元，可增加基金300万元；个人筹资标准由今年的60元提高到100元，可增加基金400万元左右。
从全疆2013年筹集情况来看，县市财政配套补助最高的是和丰县，105元；库车、新和、拜城县均为101元，沙雅县91元，阿克苏市84元。个人缴费最高的霍城县，111元，墨玉县109元。轮台、博湖、和硕也拟将2014年县级财政、个人缴费都提高至100元。
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