加盟这一零售经营模式既是国际惯例，也是成熟的商业模式，国际上和国内其它行业如餐饮、快消品、服装店、甚至娱乐行业大有成熟且稳定的加盟店，连锁药店行业的加盟模式，其所以存在加而不盟，连而不锁的状况，但是，下一个阶段，连锁药店的发展壮大，正好增长点在加盟店，尤其是在三四级市场的加盟店，是连锁快速扩张的最有效途径之一，因为医药个体代理商和厂商的OTC代表都有转型的需求，同时一些诊所医生受到新医改国家扶持政府举办医疗机构的挤压，也在寻求转型做药店，其它行业资本同样有转型做药店产业的需求，正在寻求出路。
一、目前家门店存在的问题及原因分析
一是加盟店没有完全从总部进货，原因有三：一是加盟伊始就没有要求加盟店100%从这部进货，家门店主也就习惯了从总部以外的其它渠道进货；二是信息系统不统一，无法及时掌握加盟店主是否从其它渠道进货；三是总部产品没有价格优势，缺乏独家高毛产品群，以及配送不够及时；四是没有及时检查监管控制，从其他渠道进了货也不收处罚。
二是加盟店不服从管理，常有违规行为，主要原因有一下几点：二是加盟店主总是一自己利益为导向，不规范的行为带来的利益总是最大化的；二是总部不能改变观念，总是想以管理为主，而不是以服务为主；三是不能协助加盟店管理升级，总部管理人员和管理水平跟不上，或者管理半径不到位，无法进行好的管理，加盟店感觉不到管理带来的好处，只感觉受到了约束。
二、如何升级改造加盟店
1、分步通过品种营销From EMKT.com.cn进行改造法：
第一步，先进行独特高毛利产品群的规划与营销工作，加大高毛利产品群构建的力度，加大高毛利产品的独特性，采取品种、规格、剂型、产地、企业不同的方式，构建差异性。
同时培训自己高毛利产品的销售技巧和联合用药手册，教会加盟店主和店员会卖自己的高毛利产品。等加盟店的高毛利产品形成习惯和依赖后，就有一定的粘合力了，就可以开展第二步的工作
第二步，品牌产品集采，通过和厂家谈判降低采购价格，以比外面商业公司更低的价格供应家门店，或者持平，加盟店就会自动愿意从总部进货，同时进货金额越大享受的各种优惠与服务就越多。
第三步：彻底要求从总部进货，公司出资，协助加盟店更换信息系统，要求采取统一进货渠道和信息系统才成为可能，否则，总部就是瞎的和盲的。
2、资金收购改造法
就象广东本草药业一样，通过控股实现统一管理，等你是大股东时，你就可以说了算，强硬要求说了算，否则，派出店长，这一步骤同样需要分几步走。
第一步，试点托管模式，通过准确盘点与类似尽职调查，弄清门店戳价值，通过经营分析诊断，找出其存在问题，当有把我大幅度提升门店业绩时，与加盟店主商谈具体托管或者管理输出方案，让其盈利水平快速提升，让其赚到钱，以此影响和说服店长服从总部管理。
第二步，通过自己的培训学院，培养大量的优秀店长贮备人才，采取人才派出托管模式，影响加盟店，起到监管和协助其提升的作用。
第三步：先选比较有潜力和经营缺乏方法的加盟店先来控股，通过管理输出，快速提升业绩，同时加强管理，让店主尝到甜头，自然也就会服从管理。很多加盟店，经营还是原始方法每提升的空间很大。
3、加强管理与培训督导提升法
建立加盟营运部和市场部，采取片区制管理，分片区责任到人。
市场部和营运部一起，加强需求调研，企划出系列促销活动、系列经营指导活动、系列门店管理、品类管理、客类管理、促销管理、会员管理的指导与服务；
营运部针对需求，拿出一套系统的培训和培训结果实施指导方案，有培训、考试、督导演练、激励、处罚，协助其去提升药学知识和联合用药知识，快速提升门店营业额。我们知道，其实加盟店缺乏的是系统专业的培训和对培训的认识、及其配需那效果的转化体系。
逐步加强纪律性和督导检查的力度，奖励和处罚并重，没有违规且，配合最好的重奖，违规者处罚且通报，杀鸡给猴看，重罚一两个违规者，慢慢纠正和改变加盟店主的习惯，同时可联合药监部门突击检查，让药监部门重罚，让其吸取教训。
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