李克强指出，近年来，各地区、各部门坚持环境保护基本国策，不断加大农村污染防治和生态保护力度，取得了积极成效。同时也要清醒地看到，农村环保工作仍然十分薄弱，农村环境形势依然严峻。他说，我国仍然是农业大国，大多数人口生活在农村，绝大多数自然资源开发利用活动也发生在农村，做好农村环保工作具有十分重要的意义。
李克强强调，建设生态文明，统筹城乡发展，建设社会主义新农村，保障改善民生，都迫切需要加强农村环境保护。他说，农村和农业是连接人与自然的主要纽带，农村地区是中华民族生存和发展的重要根基，必须站在国家生态安全的战略高度，推进农村生态文明建设。环境是人们生存和发展的基本条件，是关系民生的重大问题。随着经济社会发展，农民群众对生活质量和环境质量有了更高的期盼，要求切实解决关系民生的突出环境问题，为广大农村实现全面小康提供良好的环境保障。城市环境与农村环境是有机整体，务必改变农村环境保护薄弱的状况，保障城乡居民的“菜篮子”、“米袋子”和“水缸子”安全，促进城乡全面协调可持续发展。
李克强指出，加强农村环境保护，要深入贯彻落实科学发展观，坚持统筹规划、突出重点，着力解决危害农民群众身体健康、威胁城乡居民食品安全、影响农业农村可持续发展的突出环境问题；坚持依靠科技、创新机制，着力建立健全农村环境保护的政策体系和长效机制。
李克强强调，农村环保是一项系统工程，需要分步实施。近期重点要突出抓好农村饮水安全，加大饮用水水源保护和监管力度，有序推进乡镇污水处理设施建设，加快解决部分农村人口喝不上干净水的问题，建设清洁水源。要着力防治工农业生产污染，严格工矿企业环境准入和达标排放，强化节能减排，加强土壤污染和农业面源污染防治，建设清洁田园。要稳步推进农村环境综合整治，实行“以奖促治”集中整治危害严重的环境问题，实行“以奖代补”鼓励开展生态示范创建，建设清洁家园。综合整治一定要从实际出发，尊重农民意愿，务求实效。
李克强说，在新的形势下，做好农村环保工作，要处理好农村经济发展与环境保护的关系，在经济发展中促进保护，在保护环境中求得发展，实现经济发展与环境保护“双赢”；处理好城市环保与农村环保的关系，逐步改变农村与城市环境保护不平衡的状况，从总体上全面改善环境质量；处理好主动预防与被动治理的关系，预防和治理并重，多还旧账不欠新账。他最后要求，各地区、各部门要进一步提高认识，加强领导、明确责任，完善政策、增加投入，统筹规划、分步实施，推进环境保护历史性转变，使改善农村环境质量不断取得新成效。
会议确定我国农村环境保护的主要目标是：到２０１０年，农村饮用水水源地水质有所改善，农业面源污染防治取得一定进展，严重的农村环境健康危害得到有效控制。农村生活污水处理率、生活垃圾处理率、畜禽粪便资源化利用率、测土配方施肥技术覆盖率、低毒高效农药使用率均提高１０％以上。到２０１５年，农村人居环境和生态状况明显改善，农村环境监管能力显著提高。
这次会议是新中国成立以来首次召开的全国农村环境保护会议。会上，环境保护部、发展改革委、财政部负责同志提出了加强农村环保的政策措施和工作要求，江苏、浙江、四川省政府负责同志介绍了有关做法和经验。中共中央、全国人大常委会、国务院和全国政协有关部门及解放军总后勤部负责同志在北京主会场参加了会议。各省、自治区、直辖市和新疆生产建设兵团负责同志，各地（市）和县（区）主要负责同志在分会场参加了会议。
